Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CrxO54751 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
CrxO54751 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms