Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Opn1mwO35599 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Opn1mwO35599 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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