Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PrkcshO08795 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrkcshO08795 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PrkcshO08795 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PrkcshO08795 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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