Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms