Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Gm20918J3QN17 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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