Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Top6blJ3QMY9 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top6blJ3QMY9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms