Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm3415J3QMS8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm3415J3QMS8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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