Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbip1J3QMK2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbip1J3QMK2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbip1J3QMK2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Bbip1J3QMK2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Bbip1J3QMK2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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