Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34c3J3QJW5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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