Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LctF8VPT3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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