Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rdh16f1E9Q9P8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Rdh16f1E9Q9P8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rdh16f1E9Q9P8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Rdh16f1E9Q9P8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rdh16f1E9Q9P8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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