Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myo5cE9Q1F5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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