Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ddx60E9PZQ1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx60E9PZQ1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms