Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nlrc5C3VPR6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nlrc5C3VPR6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms