Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppfia1B2RXQ2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia1B2RXQ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms