Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cspp1B2RX88 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms