Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms