Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Trabd2bB1ATG9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trabd2bB1ATG9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Trabd2bB1ATG9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Trabd2bB1ATG9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trabd2bB1ATG9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Trabd2bB1ATG9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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