Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Samt1A2BED8 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Samt1A2BED8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms