Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ambra1A2AH22 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ambra1A2AH22 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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