Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chd5A2A8L1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Chd5A2A8L1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Chd5A2A8L1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chd5A2A8L1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chd5A2A8L1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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