Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5538W4VSP6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm5538W4VSP6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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