Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms