Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms