Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdpk1Q9Z2A0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdpk1Q9Z2A0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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