Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Gpc6Q9R087 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gpc6Q9R087 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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