Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nectin3Q9JLB9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms