Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Scamp5Q9JKD3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Scamp5Q9JKD3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms