Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
OtofQ9ESF1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
OtofQ9ESF1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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