Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clstn2Q9ER65 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clstn2Q9ER65 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms