Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Xab2Q9DCD2 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms