Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Syde1Q9DBZ9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms