Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q9DAE8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9DAE8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q9DAE8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms