Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Q9D7E4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D7E4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms