Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Phf6Q9D4J7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Phf6Q9D4J7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms