Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Odf2lQ9D478 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Odf2lQ9D478 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Odf2lQ9D478 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Odf2lQ9D478 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Odf2lQ9D478 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms