Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Susd3Q9D176 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Susd3Q9D176 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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