Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Shisa9Q9CZN4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Shisa9Q9CZN4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms