Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CWU4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CWU4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms