Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Ykt6Q9CQW1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms