Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccer1Q9CQL2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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