Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Znhit3Q9CQK1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms