Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pkp2Q9CQ73 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms