Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Chmp3Q9CQ10 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Chmp3Q9CQ10 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Chmp3Q9CQ10 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Chmp3Q9CQ10 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Chmp3Q9CQ10 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chmp3Q9CQ10 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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