Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt88Q9CPR6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Krt88Q9CPR6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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