Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Bhlhe41Q99PV5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Bhlhe41Q99PV5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms