Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NsmfQ99NF2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NsmfQ99NF2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms