Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Brms1Q99N20 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Brms1Q99N20 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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