Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Rcbtb2Q99LJ7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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