Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp16Q99LG0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp16Q99LG0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms